Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLK1P49759 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLK1P49759 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms