Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPAP49450 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPAP49450 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPAP49450 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms