Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM4P49221 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM4P49221 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM4P49221 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms