Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms