Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCAMP43121 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCAMP43121 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCAMP43121 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms