Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3CAP42336 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms