Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGCXP38435 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms