Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC8P31273 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms