Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA11P31270 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA11P31270 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms