Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25CP30307 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms