Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMOD1P29536 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD1P29536 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms