Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CANXP27824 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CANXP27824 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CANXP27824 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CANXP27824 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CANXP27824 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CANXP27824 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CANXP27824 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CANXP27824 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CANXP27824 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CANXP27824 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CANXP27824 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms