Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.62□□□□□ -1.83
SPT5P27692 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.62□□□□□ -1.83
SPT5P27692 RPS21AYKR057W 264 nt3.62□□□□□ -1.83
SPT5P27692 AI2Q0055 2565 nt3.62□□□□□ -1.83
SPT5P27692 VPH1YOR270C 2523 nt3.62□□□□□ -1.83
SPT5P27692 SMC2YFR031C 3513 nt3.61□□□□□ -1.83
SPT5P27692 VPS34YLR240W 2628 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 YBL065WYBL065W 345 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 YLR149CYLR149C 2193 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 GIS4YML006C 2325 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 ENA5YDR038C 3276 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 ENA2YDR039C 3276 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 ENA1YDR040C 3276 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 DNL4YOR005C 2835 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 RCY1YJL204C 2523 nt3.6□□□□□ -1.83
SPT5P27692 KSP1YHR082C 3090 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 GCN1YGL195W 8019 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 RRP12YPL012W 3687 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 PSF1YDR013W 627 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 SGF11YPL047W 300 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 CSR2YPR030W 3366 nt3.59□□□□□ -1.83
SPT5P27692 DYN1YKR054C 12279 nt3.59□□□□□ -1.84
SPT5P27692 ROG1YGL144C 2058 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 INP2YMR163C 2118 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 RPS28BYLR264W 204 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 COS111YBR203W 2775 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 RSN1YMR266W 2862 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 SEF1YBL066C 3447 nt3.58□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YEL043WYEL043W 2871 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PAU10YDR542W 363 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PAU11YGL261C 363 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PXA2YKL188C 2562 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 HRD3YLR207W 2502 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PAU4YLR461W 363 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 SIN3YOL004W 4611 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YPR089WYPR089W 2667 nt3.57□□□□□ -1.84
SPT5P27692 ORC2YBR060C 1863 nt3.56□□□□□ -1.84
SPT5P27692 GRR1YJR090C 3456 nt3.56□□□□□ -1.84
SPT5P27692 MPT5YGL178W 2580 nt3.56□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YBT1YLL048C 4986 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 NOP10YHR072W-A 177 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 COX14YML129C 213 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PRP6YBR055C 2700 nt3.55□□□□□ -1.84
SPT5P27692 STE6YKL209C 3873 nt3.54□□□□□ -1.84
SPT5P27692 ULI1YFR026C 510 nt3.54□□□□□ -1.84
SPT5P27692 SPO71YDR104C 3738 nt3.54□□□□□ -1.84
SPT5P27692 YBR184WYBR184W 1572 nt3.54□□□□□ -1.84
SPT5P27692 VAS1YGR094W 3315 nt3.54□□□□□ -1.84
SPT5P27692 SPO14YKR031C 5052 nt3.53□□□□□ -1.84
SPT5P27692 FLO1YAR050W 4614 nt3.53□□□□□ -1.84
SPT5P27692 PFF1YBR074W 2931 nt3.53□□□□□ -1.84
SPT5P27692 DSE4YNR067C 3354 nt3.52□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RPS12YOR369C 432 nt3.52□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RGR1YLR071C 3249 nt3.51□□□□□ -1.85
SPT5P27692 STU2YLR045C 2667 nt3.51□□□□□ -1.85
SPT5P27692 HEH2YDR458C 1992 nt3.51□□□□□ -1.85
SPT5P27692 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.51□□□□□ -1.85
SPT5P27692 CLN3YAL040C 1743 nt3.5□□□□□ -1.85
SPT5P27692 FMP16YDR070C 282 nt3.5□□□□□ -1.85
SPT5P27692 PEP3YLR148W 2757 nt3.5□□□□□ -1.85
SPT5P27692 NET1YJL076W 3570 nt3.5□□□□□ -1.85
SPT5P27692 SMY1YKL079W 1971 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 ECM12YHR021W-A 456 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 YBL053WYBL053W 375 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 POL3YDL102W 3294 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 REC8YPR007C 2043 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 TAO3YIL129C 7131 nt3.49□□□□□ -1.85
SPT5P27692 TAF2YCR042C 4224 nt3.48□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RPL22AYLR061W 366 nt3.48□□□□□ -1.85
SPT5P27692 YOR218CYOR218C 420 nt3.48□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RPA135YPR010C 3612 nt3.48□□□□□ -1.85
SPT5P27692 PRP42YDR235W 1635 nt3.48□□□□□ -1.85
SPT5P27692 YNL114CYNL114C 372 nt3.47□□□□□ -1.85
SPT5P27692 TFC1YBR123C 1950 nt3.47□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RRM3YHR031C 2172 nt3.46□□□□□ -1.85
SPT5P27692 RPL23BYER117W 414 nt3.46□□□□□ -1.86
SPT5P27692 snR43snR43 209 nt3.46□□□□□ -1.86
SPT5P27692 POL2YNL262W 6669 nt3.46□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YIL080WYIL080W 4722 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 RPH1YER169W 2391 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 snR72snR72 98 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 DYN2YDR424C 279 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 RPB10YOR210W 213 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 SNF5YBR289W 2718 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YTA7YGR270W 4140 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 SUL1YBR294W 2580 nt3.45□□□□□ -1.86
SPT5P27692 TAE2YPL009C 3117 nt3.44□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
SPT5P27692 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
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