Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms