Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms