Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms