Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BPBP20851 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms