Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms