Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms