Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms