Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF4P18085 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF4P18085 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF4P18085 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms