Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF7P17544 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF7P17544 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF7P17544 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF7P17544 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF7P17544 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms