Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB4P17483 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB4P17483 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms