Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPCAMP16422 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPCAMP16422 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPCAMP16422 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPCAMP16422 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EPCAMP16422 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPCAMP16422 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms