Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCFC2P16383 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms