Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFAP15692 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms