Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CETPP11597 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CETPP11597 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CETPP11597 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CETPP11597 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CETPP11597 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CETPP11597 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CETPP11597 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms