Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALAP11233 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RALAP11233 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALAP11233 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALAP11233 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALAP11233 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALAP11233 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALAP11233 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALAP11233 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALAP11233 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALAP11233 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms