Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMC1P11047 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms