Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARBP10826 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARBP10826 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARBP10826 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RARBP10826 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARBP10826 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RARBP10826 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms