Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HKR1P10072 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HKR1P10072 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HKR1P10072 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HKR1P10072 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HKR1P10072 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HKR1P10072 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HKR1P10072 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms