Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD2P0DJD1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms