Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD1P0DJD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD1P0DJD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD1P0DJD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD1P0DJD0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD1P0DJD0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms