Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACAA1P09110 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms