Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRCP08575 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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