Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI1P08151 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI1P08151 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI1P08151 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms