Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NGFRP08138 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NGFRP08138 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NGFRP08138 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NGFRP08138 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NGFRP08138 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NGFRP08138 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms