Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APBA3O96018 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APBA3O96018 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APBA3O96018 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APBA3O96018 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APBA3O96018 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APBA3O96018 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APBA3O96018 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APBA3O96018 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APBA3O96018 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms