Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR1AO95602 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms