Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms