Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX15O60248 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms