Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP9BO43861 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms