Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1BO43795 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1BO43795 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms