Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCP110O43303 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCP110O43303 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCP110O43303 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCP110O43303 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms