Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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