Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRXO43186 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRXO43186 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRXO43186 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRXO43186 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRXO43186 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms