Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms