Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APAF1O14727 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APAF1O14727 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APAF1O14727 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APAF1O14727 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APAF1O14727 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms