Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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