Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AGRNO00468 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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